«Bioinformatics Sequence Optimization» در حوزه بیوانفورماتیک به مفهومی تخصصی درباره Sequence اشاره دارد و با توالی‌یابی، ژنوم، variant، protein، expression، داده آزمایشگاهی و تحلیل زیستی مرتبط است. در اینجا «Optimization» معمولاً به معنی فرایند بهینه‌سازی کارایی، هزینه یا کیفیت است و کمک می‌کند نقش این مفهوم در سیستم دقیق‌تر تفکیک شود. این اصطلاح معمولاً هنگام تحلیل sequence، فیلتر variant یا ساخت ماتریس بیان ژن کاربرد دارد و هدفش استخراج معنا از داده‌های زیستی و افزایش تکرارپذیری تحلیل است. شناخت درست آن برای مستندسازی، طراحی، عیب‌یابی و تصمیم‌گیری تیمی مهم است، چون باعث می‌شود مرز مسئولیت‌ها، ریسک‌ها و وابستگی‌ها روشن‌تر شوند و نتیجه نهایی به پژوهش زیستی سریع‌تر و قابل اتکاتر نزدیک‌تر باشد.